Le Capitaine et le Lieutenant Scott sont partie ensemble a bord d'un Jumper avec comme missions de ravitailler les Athosiens sur le continent. Arriver là bas ils ont du faire face a une créature inconnu. Après de multiple attaque, les deux officiers sorte l'artillerie lourde pour venir a bout de la bête et s'aide mutuellement. Il en ressortira une vrais fraternité entre les deux officiers.

Après avoir installé la charmante Docteur Keller dans un local du village afin qu'elle puisse soigné les habitants de celui-ci, le Lieutenant Scott et son équipe se sont mis à la disposition du Docteur et a créer une bulle de sécurité au tours de la zone d'opération. Les choses ont mal tournée, des séparatiste Genii on apprit notre présence ici et on essayer de nous capturé. Les deux Marines on étaient tué et les deux scientifique enlevé. Le Lieutenant a fait son maximum pour sauver le Docteur Keller, ce qu'il réussie a faire. Il serra bléssé au combat à la jambe droite. Une légère blessure que le Docteur lui soignera une fois rentré sur Atlantis.
La Missions a développé chez les deux protagoniste une relation de confiance et d'amitié qui aujourd'hui évolue encore.

Après leurs missions sur MXP-348, la jeune femme a demandé au Lieutenant une petite formation au combat rapproché, afin qu'elle puisse mieux se défendre. Le Lieutenant a accepté et en a profité pour faire connaissance avec Jennifer, plus le temps passe plus Matthew l'apprécie. Peut être un début de sentiment ?
Les deux amis se sont entrainer après avoir mangé ensemble au Mess puis on fini la soirée tout les deux à l'infirmerie alors que le Docteur était de garde, Matthew lui a tenu compagnie quelque heure avant de la laisser faire son travail tranquillement.

Durant la Missions sur MXP-348, le jeune Lieutenant Scott avait promis à la belle Jennifer Keller de l'inviter a boire un verre. Chose promise, chose due. Il l'a invité a boire un verre sur une des digues de la cité. C'est l'occasion pour lui de se rapproché de la femme pour qui il développe des sentiments.

Après qu'un Genii irradié est venu mourir sur Atlantis une équipe est envoyé sur une planète où les Genii pourrait faire des expérience Nucléaire. L'équipe est dirigé par le Capitaine Brown jeune et brillante officier de SGA-3. Le Lieutenant Scott comble les effectif de son équipe et vient en soutien. L'équipe progresse sur la planète et tombe dans une embuscade Genii.